ファイルとフォルダの神隠しを使わせてもらっています。
表示に関する設定で、
「常駐時タスクトレイにアイコンを表示しない」にチェックを入れて再起動した所、
それ以降、プログラム本体の設定画面を出せなくなりました。
使用OSは Vista Home Premium SP2です。
よろしくお願いいたします。